Гены домашнего хозяйства как внутренние стандарты: применение и ограничения

Количественные исследования широко проводят в биомедицине для сравнения экспрессии РНК в различных экспериментальных или клинических условиях. Количественную оценку экспрессии выполняют путем сравнения с экспрессией транскриптов генов домашнего хозяйства, таких как глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа (G3PDH), альбумин, актины, тубулины, циклофилин, гипоксантинфосфорибозилтрансфераза (HRPT) и L32. В качестве внутренних стандартов также используют рРНК 28S и 18S. В статье показано, что содержание широко применяемых внутренних стандартов может количественно изменяться под воздействием различных факторов. Возможные вариации проиллюстрированы на трех экспериментальных примерах. Для каждого из этих образцов предложены предпочтительные типы внутренних стандартов; далее обсуждаются общий подход к выбору внутреннего стандарта и правила его использования.