Определение популяционной структуры по данным многолокусных генотипов

Мы описываем метод кластеризации на основе модели, который позволяет использовать данные многолокусных генотипов для определения популяционной структуры и отнесения особей к популяциям. Предполагается, что существуют K популяций (число K может быть неизвестно), каждая из которых характеризуется набором частот аллелей по каждому локусу. Особей из выборки вероятностно относят к популяциям, а при наличии признаков смешанного происхождения — одновременно к двум или более популяциям. Модель не предполагает определённого мутационного процесса и применима к большинству широко используемых генетических маркеров при условии, что соответствующие локусы не сцеплены тесно. Метод можно использовать для выявления популяционной структуры, отнесения особей к популяциям, изучения гибридных зон, а также выявления мигрантов и особей со смешанным происхождением. Мы показываем, что метод обеспечивает высокую точность отнесения даже при небольшом числе локусов: например, для этого хватило семи микросателлитных локусов в исследовании генотипов исчезающего вида птиц. Программное обеспечение, использованное в этой статье, доступно по адресу http://www.stats.ox.ac.uk/~pritch/home.html.