Усовершенствование метода анализа полиморфизма длин рестрикционных фрагментов для изучения разнообразия генов nifH в сообществах почвенных азотфиксаторов
Improvement in the RFLP procedure for studying the diversity of nifH genes in communities of nitrogen fixers in soil
Аннотация
Несколько специфичных праймеров к гену nifH проверили на различных чистых культурах почвенных азотфиксирующих штаммов. Пара праймеров PolF/PolR обеспечила успешную амплификацию генов у 19 типичных азотфиксирующих штаммов. Для анализа полиморфизма длин рестрикционных фрагментов (ПДРФ) отобрали три рестриктазы — HaeIII, NdeII и MnlI: они наиболее чётко выявляли различия между штаммами на видовом уровне. Амплификацию с выбранными праймерами и анализ ПДРФ применили для оценки генетического разнообразия пула генов nifH в почве. В двух сопоставляемых почвах — одна использовалась для возделывания сельскохозяйственных культур, другая находилась под постоянным пастбищем — обнаружили различия в разнообразии генов nifH. Профили чистых культур не удалось распознать в профилях почвенных образцов. Описанный простой метод показал, что структура сообщества почвенных азотфиксаторов зависит от функционирования почвы.
Переведем эту статью за 1 час
Загрузите PDF, а мы сделаем полный перевод, краткий конспект и красивую инфографику.
Попробовать бесплатно →Также в Подтеме: еженедельные литобзоры, база международных клинреков и конспекты свежих мед. статей и подкастов каждый день.