Микробное разнообразие и функционирование в почве: от генов к экосистемам

В почвах обитает огромное разнообразие микроорганизмов, которое в значительной мере остаётся неизученным. С помощью новых методов, большинство из которых основано на анализе рРНК и рДНК, удалось выявить часть этого разнообразия. Следующий этап развития микробной экологии — извлечение геномной, эволюционной и функциональной информации из библиотек бактериальных искусственных хромосом, созданных на основе геномов почвенного сообщества (метагенома). Сложные методы анализа, включающие молекулярную филогенетику, ДНК-микрочипы, функциональную геномику и измерение активности непосредственно в почве, позволят получить огромный объём новых данных. Это может углубить понимание структуры и функционирования почвенных микробных экосистем, а также взаимодействий внутри них. В этом обзоре обобщён прогресс в изучении почвенных микробных сообществ; особое внимание уделено новым методам и подходам, позволяющим лучше понять связь между филогенетическим и функциональным разнообразием.