Разработка и стандартизация праймеров и протоколов ПЦР для выявления клональных перестроек генов иммуноглобулинов и Т-клеточного рецептора при подозрении на лимфопролиферативное заболевание: отчёт по проекту BIOMED-2 BMH4-CT98-3936

В рамках европейского совместного исследования BIOMED-2 были успешно разработаны и стандартизированы мультиплексные ПЦР-тесты для выявления клональных перестроек генов иммуноглобулинов (Ig) и Т-клеточного рецептора (TCR), а также хромосомных аберраций t(11;14) и t(14;18). В результате созданы наборы из 107 различных праймеров, распределённых всего по 18 пробиркам для мультиплексной ПЦР: три набора VH-JH, два DH-JH, два для каппа-цепи иммуноглобулина (IGK), один для лямбда-цепи иммуноглобулина (IGL), три для TCRβ (TCRB), два для TCRγ (TCRG), один для TCRδ (TCRD), три для BCL1-IGH и один для BCL2-IGH. Продукты ПЦР генов Ig/TCR можно анализировать для оценки клональности методом анализа гетеродуплексов или GeneScanning. Частота выявления клональных перестроек с помощью наборов праймеров BIOMED-2 беспрецедентно высока, главным образом благодаря взаимодополняемости различных наборов. В частности, совместное использование наборов IGH (VH-JH и DH-JH) и IGK позволяет выявлять практически все клональные В-клеточные пролиферации, даже при злокачественных новообразованиях В-клеток с высоким уровнем соматических мутаций. Вклад перестроек гена IGL, по-видимому, невелик. Совместное применение наборов TCRB и TCRG позволяет выявлять практически все клональные Т-клеточные популяции, тогда как набор TCRD особенно полезен при пролиферациях TCRγδ-положительных Т-клеток. Мультиплексные наборы BIOMED-2 можно использовать для диагностики клональности, а также для определения мишеней ПЦР, пригодных для выявления минимальной остаточной болезни.