WebLogo: генератор логотипов последовательностей

WebLogo создаёт логотипы последовательностей — графическое представление закономерностей, выявляемых при множественном выравнивании последовательностей. Логотипы последовательностей дают более содержательное и точное описание сходства последовательностей, чем консенсусные последовательности, и позволяют быстро обнаруживать значимые особенности выравнивания, которые иначе трудно заметить. Каждый логотип состоит из стопок букв: по одной стопке на каждую позицию последовательности. Общая высота каждой стопки отражает степень консервативности данной позиции, измеряемую в битах, а высота символов внутри стопки — относительную частоту соответствующей аминокислоты или нуклеинового основания в этой позиции. Недавно WebLogo был дополнен новыми функциями и настройками, что сделало его удобным и гибко настраиваемым генератором логотипов последовательностей. Интерфейс командной строки и полный исходный код WebLogo с открытой лицензией доступны для локальной установки и адаптации.