«Candidatus Phytoplasma» — таксон для неспиральных прокариот, лишённых клеточной стенки, которые заселяют флоэму растений и насекомых

Общее название «фитоплазмы» принято для обозначения лишённых клеточной стенки неспиральных прокариот, заселяющих флоэму растений и насекомых; ранее их называли микоплазмоподобными организмами. Хотя фитоплазмы пока не удалось культивировать in vitro, филогенетический анализ различных консервативных генов показал, что они образуют отдельную монофилетическую кладу в классе Mollicutes. В настоящей работе предлагается объединить фитоплазмы в новый род «Candidatus (Ca.) Phytoplasma». С учётом разнообразия внутри «Ca. Phytoplasma» для организмов, сходство последовательностей гена 16S рРНК которых составляет менее 97,5%, необходимо выделить несколько подтаксонов. В настоящем сообщении описаны свойства таксона «Ca. Phytoplasma», включающего виды «Ca. Phytoplasma aurantifolia» (прокариот, связанный с болезнью ведьминой метлы мелкоплодного кислого лайма), «Ca. Phytoplasma australiense» (связанный с пожелтением винограда в Австралии), «Ca. Phytoplasma fraxini» (связанный с пожелтением ясеня), «Ca. Phytoplasma japonicum» (связанный с филлодией гортензии в Японии), «Ca. Phytoplasma brasiliense» (связанный с болезнью ведьминой метлы гибискуса в Бразилии), «Ca. Phytoplasma castaneae» (связанный с болезнью ведьминой метлы каштана в Корее), «Ca. Phytoplasma asteris» (связанный с желтухой астры), «Ca. Phytoplasma mali» (связанный с пролиферацией яблони), «Ca. Phytoplasma phoenicium» (связанный с летальной болезнью миндаля), «Ca. Phytoplasma trifolii» (связанный с пролиферацией клевера), «Ca. Phytoplasma cynodontis» (связанный с белолистностью свинороя), «Ca. Phytoplasma ziziphi» (связанный с болезнью ведьминой метлы унаби), «Ca. Phytoplasma oryzae» (связанный с карликовостью риса), а также шесть таксонов видового уровня, для которых обозначение вида Candidatus ещё не было официально предложено. Речь идёт о фитоплазмах, связанных соответственно с болезнью X персика, золотистым пожелтением винограда, летальным пожелтением кокосовой пальмы в Центральной Америке, летальным усыханием кокосовой пальмы в Танзании, летальным усыханием кокосовой пальмы в Нигерии и болезнью ведьминой метлы люффы. Для организмов, которые, несмотря на сходство последовательности гена 16S рРНК более чем на 97,5% с последовательностями других видов «Ca. Phytoplasma», отличаются биологическими, фитопатологическими и генетическими свойствами, необходимо выделить дополнительные виды. К ним относятся «Ca. Phytoplasma pyri» (связанный с упадком груши), «Ca. Phytoplasma prunorum» (связанный с европейским пожелтением косточковых культур), «Ca. Phytoplasma spartii» (связанный с болезнью ведьминой метлы ракитника), «Ca. Phytoplasma rhamni» (связанный с болезнью ведьминой метлы крушины), «Ca. Phytoplasma allocasuarinae» (связанный с пожелтением аллоказуарины), «Ca. Phytoplasma ulmi» (связанный с пожелтением вяза), а также дополнительный таксон для фитоплазмы столбура. Напротив, некоторые организмы, несмотря на то что сходство последовательности их гена 16S рРНК с последовательностями любых других видов «Ca. Phytoplasma» составляет менее 97,5%, пока не описаны как виды Candidatus из-за недостаточной общей изученности.