Надсемейство C-лектиноподобных доменов

Надсемейство белков, содержащих C-лектиноподобные домены (CTLD), представляет собой многочисленную группу внеклеточных белков многоклеточных животных с разнообразными функциями. Для структуры CTLD характерна двойная петля («петля в петле»), стабилизированная двумя высококонсервативными дисульфидными связями, расположенными у оснований петель, а также рядом консервативных гидрофобных и полярных взаимодействий. Вторая петля, называемая длинной петлевой областью, отличается структурной и эволюционной вариабельностью и участвует в кальций-зависимом связывании углеводов и взаимодействии с другими лигандами. У части CTLD эта петля полностью отсутствует; такие домены мы называем компактными CTLD. К ним относятся Link/PTR-домен и бактериальные CTLD. Изначально белки, содержащие CTLD (CTLDcps), классифицировали на семь групп на основании их общей доменной структуры. Анализ представленности этого надсемейства в нескольких полностью секвенированных геномах позволил добавить к классификации 10 новых групп и показал, что она применима только к белкам, содержащим CTLD, у позвоночных: несмотря на многочисленность CTLDcps в изученных геномах беспозвоночных, доменная архитектура этих белков не соответствует архитектуре групп позвоночных. Кальций-зависимое связывание углеводов — наиболее распространённая функция CTLD у позвоночных и, по-видимому, исходная функция этого домена, о чём свидетельствует большое число охарактеризованных CTLDcps, участвующих в гуморальной защите насекомых и других беспозвоночных. Однако многие CTLD эволюционировали для специфического распознавания белковых, липидных и неорганических лигандов, включая змеиные яды, характерные для отдельных клад позвоночных, а также антифризные белки рыб и белки яичной скорлупы птиц. Недавние исследования подчёркивают функциональную универсальность этого надсемейства белков и каркаса CTLD и указывают на возможность новых интересных открытий.