Достижения в гомологическом моделировании структуры белков

Гомологическое моделирование играет центральную роль в определении структуры белков в рамках проекта структурной геномики. Его значение постоянно возрастает из-за огромного разрыва между числом доступных последовательностей белков и числом структур, определённых экспериментально, а также, что ещё важнее, благодаря повышению надёжности и точности метода. Последовательность белка, идентичная более чем на 30% последовательности белка с известной структурой, часто позволяет получить модель с точностью, сопоставимой со структурой, определённой методом рентгеновской кристаллографии с низким разрешением. Недавние достижения в гомологическом моделировании — прежде всего в выявлении отдалённых гомологов, выравнивании последовательностей со структурами-шаблонами, моделировании петель и боковых цепей, а также выявлении ошибок в модели — сделали возможным надёжное предсказание структуры белков, которое ещё несколько лет назад было недостижимо. Продолжающиеся работы по определению структур белков, зачастую длительные и сложные, будут и дальше стимулировать разработку множества новых вычислительных методов, способных сократить этот разрыв и углубить понимание взаимосвязи структуры и функции белка.