Капиллярный электрофорез фрагментов двуцепочечной ДНК с использованием нового интеркалирующего флуоресцентного красителя EvaGreen

EvaGreen — новый интеркалирующий краситель ДНК, успешно применяемый в количественной полимеразной цепной реакции в реальном времени. В настоящей работе EvaGreen впервые использовали для анализа двуцепочечной ДНК методом капиллярного электрофореза с детекцией лазерно-индуцированной флуоресценции. При анализе двуцепочечной ДНК методом капиллярного электрофореза сравнивали краситель EvaGreen с широко используемыми красителями SYBR Green I и SYBR Gold. Диапазон линейности для двуцепочечной ДНК при использовании EvaGreen был немного шире, чем при использовании SYBR Gold и SYBR Green I, тогда как пределы обнаружения двуцепочечной ДНК для трёх красителей значимо не различались. С использованием всех трёх красителей удалось добиться хорошего разделения фрагментов двуцепочечной ДНК. Воспроизводимость времени миграции и площади пиков фрагментов двуцепочечной ДНК при использовании EvaGreen была лучше, чем при использовании SYBR Green I и SYBR Gold. Значения относительного стандартного отклонения в течение одного дня составили 0,24–0,27% для времени миграции и 3,45–7,59% для площади пика; в течение трёх дней — 1,35–1,63% и 6,72–12,05% соответственно. Полученные данные свидетельствуют о пригодности EvaGreen для анализа двуцепочечной ДНК методом капиллярного электрофореза с детекцией лазерно-индуцированной флуоресценции.