Mfuzz: программный пакет для мягкой кластеризации данных микрочипового анализа

Для анализа данных микрочипового анализа часто применяют методы кластеризации. Большинство из них основаны на жёсткой кластеризации, при которой каждый ген (или образец) относят только к одному кластеру. Однако у жёсткой кластеризации есть ряд недостатков, в том числе чувствительность к шуму и потеря информации. В отличие от неё, методы мягкой кластеризации позволяют относить ген к нескольким кластерам. Это помогает преодолеть недостатки традиционных методов жёсткой кластеризации и даёт дополнительные преимущества. Поэтому был создан пакет R Mfuzz, включающий инструменты мягкой кластеризации для анализа данных микрочипового анализа. Дополнительный пакет Mfuzzgui предоставляет удобный графический интерфейс пользователя на основе Tcl/Tk.

Доступность: Пакеты R Mfuzz и Mfuzzgui доступны по адресу http://itb1.biologie.hu-berlin.de/~futschik/software/R/Mfuzz/index.html. Они распространяются на условиях лицензии GPL версии 2.