Супертипы HLA класса I: пересмотренная и обновлённая классификация

Введение: Молекулы главного комплекса гистосовместимости (MHC) класса I связывают короткие пептиды, образующиеся при внутриклеточной переработке белков, и представляют их Т-клеткам. Репертуар пептидов конкретной молекулы в значительной степени определяется структурой молекулы, обеспечивающей размещение так называемых основных якорных позиций представляемого пептида. Эти рецепторы отличаются чрезвычайным полиморфизмом, причём значительная часть вариабельности влияет на репертуар связываемых пептидов. Однако, несмотря на этот полиморфизм, молекулы класса I можно объединить в группы, связывающие в значительной степени перекрывающиеся репертуары пептидов. Почти десять лет назад мы предложили объединять аллели человеческого лейкоцитарного антигена (HLA) в группы и выделили на основании их специфичности к основным якорным позициям девять различных групп, названных супертипами. Практическая ценность этой исходной классификации супертипов, как и нескольких последующих классификаций, разработанных другими авторами, была продемонстрирована в многочисленных исследованиях по идентификации эпитопов.

Результаты: Следуя исходному подходу, в настоящей работе мы представляем обновлённую классификацию аллелей HLA-A и HLA-B класса I по супертипам. В анализ включены большой объём данных о связывании молекул MHC класса I и сведения о последовательностях, накопленные за последнее десятилетие. В результате более 80% из 945 исследованных на сегодняшний день аллелей HLA-A и HLA-B удалось отнести к одному из исходных девяти супертипов. Ожидается, что несколько аллелей будут связаны с репертуарами, перекрывающимися с несколькими супертипами. Примечательно, что в ходе текущего анализа дополнительных специфичностей супертипов выявлено не было.

Выводы: В результате обновлённого анализа определена принадлежность к супертипам более чем для 750 различных аллелей HLA-A и HLA-B. Эти сведения должны способствовать идентификации эпитопов, разработке вакцин, а также изучению связей с заболеваниями и коррелятов иммунитета. Кроме того, использованный подход стал более прозрачным, что позволит другим исследователям применять эту классификацию в дальнейшем.