Выделение и характеристика новых полиморфных микросателлитных локусов винограда (Vitis vinifera L.)

Четыре новых микросателлитных локуса (SSR), обозначенных VVMD5, VVMD6, VVMD7 и VVMD8, охарактеризовали у винограда и исследовали методом окрашивания серебром у 77 сортов Vitis vinifera. Размер амплифицированных фрагментов составлял от 141 до 263 п. н. Число аллелей на локус варьировало от 5 до 11, а число диплоидных генотипов — от 13 до 27. В каждом локусе не менее 75% сортов были гетерозиготными. При окрашивании серебром удавалось различать аллели, отличавшиеся по длине всего на 1 п. н.; оценки размера фрагментов для каждого локуса отличались на 1 или 2 п. н. от полученных методом флуоресцентной детекции. Частоты аллелей в целом были сходными у винных и столовых сортов винограда, хотя отмечались исключения. Некоторые аллели обнаруживались только в одной из этих двух групп. Все 77 сортов удалось различить с помощью четырёх локусов, за исключением четырёх винных сортов, считающихся соматическими вариантами одного сорта: ‘Pinot noir’, ‘Pinot gris’, ‘Pinot blanc’ и ‘Meunier’; двух столовых сортов, известных как синонимы: ‘Keshmesh’ и ‘Thompson Seedless’; и трёх столовых сортов — ‘Dattier’, ‘Rhazaki Arhanon’ и ‘Markandi’, причём первые два предположительно являются синонимами. Высокий полиморфизм микросателлитных локусов винограда позволяет предположить, что теоретически для различения всех сортов достаточно небольшого числа локусов. Однако экономическая и юридическая значимость идентификации сортов винограда требует более высокой разрешающей способности, которую обеспечивает использование большего числа локусов. Простота международного обмена микросателлитными маркерами и данными должна способствовать их широкому применению, что повысит возможности этих маркеров для идентификации и генетического анализа винограда. Ключевые слова: виноград, Vitis, микросателлиты, простые повторы последовательностей, ДНК-типирование, идентификация.