Унифицированная номенклатура антимикробных пептидов, выделенных из лягушек подсемейства Phyllomedusinae

Из кожи квакшевых лягушек подсемейства Phyllomedusinae выделено большое количество катионных антимикробных пептидов. В настоящее время аминокислотные последовательности этих пептидов представлены в нескольких базах данных под идентификаторами, не соответствующими единой системе номенклатуры. Чтобы разработать рабочую терминологию для антимикробных пептидов лягушек подсемейства Phyllomedusinae, мы систематически собрали, проанализировали и классифицировали все доступные в базах данных последовательности пептидов. Мы предлагаем обозначать виды лягушек подсемейства Phyllomedusinae в соответствии с названиями видов, приведёнными в справочнике Amphibian Species of the World (http://research.amnh.org/herpetology/amphibia/index.php; Американский музей естественной истории, Нью-Йорк, США). Анализ множественного выравнивания последовательностей не менее 80 антимикробных пептидов, выделенных из 12 видов Phyllomedusinae, позволил распределить их по семи различным семействам пептидов: дермасептинам, филлосептинам, пластицину, дерматоксинам, филлоксину, гипосину и пептидам-сиротам. Эти названия будут использоваться как названия родительской группы каждого семейства. За названием родительского пептида должна следовать первая заглавная буква видового названия для ортологичных пептидов; приоритет определяется датой публикации. Например, для видов bicolor и hypochondrialis используются сокращения B и H соответственно. Если названия двух видов начинаются с одной и той же буквы, используют две заглавные буквы — первую, за которой следуют вторая, третья и так далее буквы названия. Например, для distincta, duellmani, vaillanti и vanzolinii применяют сокращения DI, DU, VA и VN соответственно. Паралогичные пептиды должны обозначаться заглавной буквой или буквами и цифрами.