Формат Sequence Alignment/Map и SAMtools
The Sequence Alignment/Map format and SAMtools
Аннотация
Сводка: Формат Sequence Alignment/Map (SAM) — универсальный формат хранения выравниваний прочтений относительно референсных последовательностей; он поддерживает короткие и длинные прочтения длиной до 128 Мпн, полученные на разных платформах секвенирования. Формат отличается гибкостью, компактностью и эффективным произвольным доступом; именно в нём публикуются выравнивания, полученные в рамках проекта «1000 геномов». SAMtools реализует различные средства последующей обработки выравниваний в формате SAM, включая индексирование, поиск вариантов и просмотр выравниваний, обеспечивая универсальный инструментарий для работы с выравниваниями прочтений.
Доступность: http://samtools.sourceforge.net.
Переведем эту статью за 1 час
Загрузите PDF, а мы сделаем полный перевод, краткий конспект и красивую инфографику.
Попробовать бесплатно →Также в Подтеме: еженедельные литобзоры, база международных клинреков и конспекты свежих мед. статей и подкастов каждый день.