Комплексный геномный анализ выявляет клинически значимые подтипы глиобластомы, характеризующиеся нарушениями в генах PDGFRA, IDH1, EGFR и NF1

Сеть проекта «Атлас генома рака» недавно систематизировала повторяющиеся геномные нарушения при глиобластоме. Мы описываем устойчивую молекулярную классификацию глиобластомы на основе экспрессии генов, выделяющую пронейральный, нейральный, классический и мезенхимальный подтипы, и объединяем многомерные геномные данные для выявления закономерностей соматических мутаций и изменения числа копий ДНК. Нарушения и экспрессия генов EGFR, NF1 и PDGFRA/IDH1 соответственно определяют классический, мезенхимальный и пронейральный подтипы. Сигнатуры экспрессии генов нормальных типов клеток мозга свидетельствуют о тесной связи между подтипами и различными нейральными линиями. Кроме того, ответ на интенсивное лечение различается в зависимости от подтипа: наибольшая польза отмечена при классическом подтипе, а при пронейральном польза отсутствовала. Мы предлагаем подход, объединяющий транскриптомные и геномные данные для молекулярной стратификации глиобластомы и имеющий важное значение для будущих исследований.