Филогенетика рода Anthyllis (Leguminosae: Papilionoideae: Loteae): частичная несогласованность ядерных и пластидных маркеров, проблема длинных ветвей и её значение для эволюции морфологических признаков

Филогенетические взаимоотношения в роде Anthyllis (Leguminosae: Papilionoideae: Loteae) изучали с использованием данных ядерных рибосомных внутренних транскрибируемых спейсеров (ITS) и трёх пластидных областей (межгенного спейсера psbA-trnH, области petB-petD и интрона rps16). Байесовский анализ и анализ методом максимальной экономии (MP) объединённого набора пластидных данных позволили получить хорошо разрешённые деревья со сходной топологией; многие клады поддерживались уникальными инделами. Анализ последовательностей ITS методами максимальной экономии и Байеса выявил несколько хорошо поддержанных различий в топологии как между самими анализами, так и по сравнению с деревьями, реконструированными на основании пластидных данных. Наиболее существенные из них касались A. vulneraria и A. lemanniana: их положение при анализе данных ITS методом максимальной экономии, по-видимому, было обусловлено сильным эффектом длинной ветви. Анализ вторичной структуры спейсера ITS1 выявил выраженное преобладание транзиций у A. vulneraria и A. lemanniana; многие из этих замен были также характерны для некоторых таксонов внешней группы. Это может способствовать противоречивому положению данной клады в дереве MP, построенном по данным ITS. Другие расхождения между пластидными и ITS-деревьями были более локальными в таксономическом отношении. Эти различия могут отражать сетчатую эволюцию близкородственных видов, включая возможное гибридное происхождение A. hystrix. Характер несогласованности между пластидными и ITS-данными, по-видимому, связан с таксономическими рангами. Все проведённые филогенетические анализы подтвердили монофилию Anthyllis, включая Hymenocarpos. Хотя роды Dorycnopsis и Tripodion часто рассматривают вместе с Anthyllis, согласно полученным данным, они находятся в более близком родстве с другими родами трибы Loteae. Мы выделили до шести крупных клад Anthyllis, морфологически хорошо охарактеризованных и потенциально соответствующих секциям. Четыре из них согласуются с различными классификациями, основанными на морфологических признаках, тогда как две другие являются новыми. Мы реконструировали эволюцию нескольких морфологических признаков, встречающихся только у Anthyllis или у трибы Loteae. Некоторые из этих признаков поддерживают крупные клады, тогда как другие свидетельствуют о наличии гомоплазии внутри Anthyllis.