Сравнение систем секвенирования нового поколения

Быстрое развитие технологий секвенирования нового поколения (NGS) и широкое распространение этих методов сделали геномные данные доступным инструментом для изучения тайн жизни, создания более совершенных сельскохозяйственных культур, выявления патогенов и улучшения качества жизни. К основным системам NGS относятся SOLiD и Ion Torrent PGM компании Life Sciences, Genome Analyzer, HiSeq 2000 и MiSeq компании Illumina, а также GS FLX Titanium и GS Junior компании Roche. Пекинский институт геномики (BGI), располагающий крупнейшими в мире мощностями для секвенирования, использует несколько систем NGS: 137 приборов HiSeq 2000, 27 SOLiD, по одному Ion Torrent PGM и MiSeq, а также один секвенатор 454. Мы накопили значительный опыт подготовки образцов, секвенирования и биоинформатического анализа. В этой статье рассмотрены технологии этих систем, обобщены и проанализированы собственные данные, полученные в ходе обширного практического опыта, и обсуждены преимущества и особенности каждой платформы. В заключение обобщены области применения NGS.