Клинические и лабораторные аспекты диагностики и лечения инфекций кожи и подкожной клетчатки, вызванных быстрорастущими микобактериями

Быстрорастущие микобактерии вызывают лёгочные, внелёгочные, системные и диссеминированные инфекции, а также инфекции кожи и подкожной клетчатки. Ошибочная идентификация быстрорастущих микобактерий только на основании микроскопии, посева на плотные и жидкие среды, систем BACTEC и видоспецифичной полимеразной цепной реакции (ПЦР) может привести к неверным результатам. В дерматологической практике это чревато назначением неадекватного лечения, увеличением числа случаев деформации кожи и рецидивов инфекции. Молекулярные методы, включая секвенирование генов 16S рРНК, rpoB и hsp65, анализ рестрикционных фрагментов продуктов ПЦР, а также секвенирование других генов — супероксиддисмутазы (SOD), dnaJ, внутренних транскрибируемых спейсеров 16S–23S рРНК (ITS), secA, recA1, dnaK и гена белка массой 32 кДа, — показали перспективность для выявления видов быстрорастущих микобактерий. Анализ рестрикционных фрагментов продуктов ПЦР позволяет точнее, чем традиционные методы, идентифицировать близкородственные виды. Сходные результаты при выявлении различных видов быстрорастущих микобактерий показали и недавно внедрённые молекулярные методы: времяпролётная масс-спектрометрия с матричной лазерной десорбцией/ионизацией (MALDI-TOF MS), пиросеквенирование, технология ДНК-биочипов и ПЦР с зондами, сочетающимися с молекулярными маяками. Близкородственные виды быстрорастущих микобактерий, например Mycobacterium fortuitum, M. chelonae и M. abscessus, необходимо чётко дифференцировать с помощью точных молекулярных методов, поскольку ответ на лечение зависит от вида возбудителя. В настоящем обзоре рассматриваются: (i) источники быстрорастущих микобактерий, предрасполагающие факторы, клинические проявления и сопутствующие грибковые инфекции; (ii) риск ошибочной диагностики инфекций, вызванных этими микроорганизмами, в дерматологической практике; (iii) диагностика и результаты лечения распространённых и редких инфекций у пациентов с иммунодефицитом и без него; (iv) традиционные и современные молекулярные методы выявления быстрорастущих микобактерий; (v) основные принципы перспективного метода MALDI-TOF MS, протокол забора материала из очагов поражения кожи и подкожной клетчатки и потенциал метода для точной дифференциации M. fortuitum, M. chelonae и M. abscessus; (vi) усовершенствование лечения инфекций, вызванных быстрорастущими микобактериями, в соответствии с недавно опубликованными рекомендациями Института клинических и лабораторных стандартов (CLSI) 2011 года, включая критерии интерпретации молекулярных методов и панелей противомикробных препаратов, а также их пороговые значения минимальной подавляющей концентрации (МПК), важные для начала противомикробной терапии.