Профили рестрикции генов рибосомной РНК как потенциальный инструмент таксономии

ДНК 41 вида бактерий, включая грамотрицательные и грамположительные виды, расщепляли различными эндонуклеазами рестрикции, разделяли электрофорезом в агарозном геле и переносили на нейлоновые фильтры. Фрагменты ДНК, содержащие гены рРНК (рДНК), выявляли методом гибридизации с зондом из 16S- и 23S-рРНК Escherichia coli, меченным 32P. Для каждой исследованной ДНК получали профиль гибридизованных фрагментов. В пределах одного вида бактерий, определённого как группа ДНК-ДНК-гибридизации, наблюдали один или несколько профилей рестрикции рДНК. При наличии данных о ДНК-ДНК-гибридизации штаммы с идентичными профилями были тесно родственны и практически не различались. В пределах одного вида разные профили соответствовали значительной дивергенции, что оценивали по термостабильности гибридов ДНК-ДНК. Наборы размеров фрагментов рестрикции рДНК могут быть полезны для включения в описания видов и типовых штаммов. В дальнейшем такие данные могут оказаться полезными для идентификации бактерий с нетипичными или недостаточно информативными биохимическими характеристиками.