Микробиом до начала лечения при впервые выявленной болезни Крона

Воспалительные заболевания кишечника (ВЗК), включая болезнь Крона (БК), генетически связаны с путями, функционирующими в организме хозяина, что указывает на роль нарушенного иммунного ответа на кишечную микробиоту. Однако закономерности дисбиоза кишечника у пациентов с ВЗК в опубликованных исследованиях неоднозначны. Мы изучили микробиом по образцам из нескольких отделов желудочно-кишечного тракта, собранным до начала лечения у пациентов с впервые выявленной БК, в крупнейшей на сегодняшний день педиатрической когорте больных БК. Выявленный профиль, характеризующийся повышенной представленностью бактерий семейств Enterobacteriaceae, Pasteurellaceae, Veillonellaceae и Fusobacteriaceae и сниженной представленностью бактерий порядков Erysipelotrichales, Bacteroidales и Clostridiales, тесно коррелировал с наличием заболевания. Сравнение микробиома пациентов с БК, получавших и не получавших антибиотики, показало, что антибиотикотерапия усиливает дисбиоз, ассоциированный с БК. Сопоставление микробных профилей образцов из подвздошной кишки, прямой кишки и кала показало, что на ранней стадии заболевания исследование микробиома слизистой прямой кишки имеет уникальный потенциал для удобной ранней диагностики БК.