Отсутствие связи генов MTHFR, MTR, MTRR и TCN2 с несиндромной расщелиной губы с/без расщелины нёба в китайской популяции: исследование случай–контроль и метаанализ

Несиндромная расщелина губы с/без расщелины нёба — распространённый врождённый порок, часто связанный с дефицитом фолатов. Гены MTHFR, MTR, MTRR и TCN2 играют ключевую роль в обмене фолатов. Риск несиндромной расщелины губы с/без расщелины нёба, связанный с определёнными вариантами генов фолатного обмена, различается в разных этнических группах. Целью исследования было выяснить, связаны ли генетические варианты этих четырёх генов, а также межгенные взаимодействия, с несиндромной расщелиной губы с/без расщелины нёба. В китайской популяции были изучены 7 тегирующих однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) гена MTHFR, 18 — гена MTR, 15 — гена MTRR и 7 — гена TCN2, отобранных по данным HapMap. Связь этих SNP с несиндромной расщелиной губы с/без расщелины нёба оценивали у 204 пациентов и 226 лиц контрольной группы. Затем был выполнен метаанализ связи rs1801133 с несиндромной расщелиной губы с/без расщелины нёба. Между группами пациентов и контроля выявили значимые различия частот аллелей и результатов гаплотипного анализа для rs4077829 и rs10802565 гена MTR, однако после поправки с использованием 10 000 перестановок эти различия перестали быть значимыми. Для других SNP значимых различий по частотам аллелей, результатам гаплотипного анализа и межгенным взаимодействиям не выявлено. По данным метаанализа, значимых различий не обнаружено при сравнении аллелей, гетерозигот, гомозигот, доминантной и рецессивной моделей. Изменения обмена фолатов, связанные с этими полиморфизмами, не участвуют в развитии несиндромной расщелины губы с/без расщелины нёба в китайской популяции.