Easy Leaf Area: автоматизированный анализ цифровых изображений для быстрого и точного измерения площади листьев

Предпосылки: Измерение площади листьев по цифровым фотографиям традиционно требует значительного участия пользователя, если фон не замаскирован заранее. Программа Easy Leaf Area разработана для пакетной обработки за несколько минут сотен изображений розеток арабидопсиса, удаления артефактов фона и сохранения результатов в файл CSV, готовый для работы с электронными таблицами.

Методы и результаты: Easy Leaf Area анализирует соотношение цветовых каналов каждого пикселя, чтобы отличать листья и калибровочные области от фона. Для определения площади программа сопоставляет число пикселей листьев с числом пикселей красной калибровочной области. Благодаря этому не нужно рассчитывать расстояние до камеры или вручную измерять масштаб по линейке, как обычно требуется в других программных методах. Оценки площади листьев по снимкам, сделанным камерой телефона, с помощью этой программы были точнее, чем оценки ImageJ по изображениям с планшетного сканера.

Выводы: Easy Leaf Area — простой в использовании метод быстрого измерения площади листьев и неразрушающей оценки площади полога по цифровым изображениям.