PLATON SQUEEZE: инструмент для расчёта вклада разупорядоченного растворителя в расчётные структурные факторы

Завершение определения кристаллической структуры часто затруднено присутствием включённых молекул растворителя или ионов, находящихся в состоянии выраженного разупорядочения. Их вклад в расчётные структурные факторы при уточнении кристаллической структуры методом наименьших квадратов необходимо каким-либо образом учитывать. Традиционно пытаются построить атомную модель разупорядоченного растворителя. Такой подход обычно предпочтителен, однако не всегда приводит к удовлетворительному результату и может оказаться невозможным, если каналы в структуре заполнены непрерывной электронной плотностью. В настоящей работе описан метод SQUEEZE как альтернативный способ решения проблемы разупорядочения растворителя. Он удобно сопрягается с версией программы уточнения методом наименьших квадратов SHELXL 2014 года [Sheldrick (2015). Acta Cryst. C71. В печати] и другими программами уточнения, допускающими использование внешних фиксированных вкладов в расчёт структурных факторов. Инструмент PLATON SQUEEZE вычисляет вклад растворителя в структурные факторы посредством обратного преобразования Фурье электронной плотности, выявленной в доступной растворителю области карты разностной электронной плотности с оптимизированными фазами. Непосредственное уточнение структуры методом наименьших квадратов выполняется, например, программой SHELXL. Текущие версии PLATON SQUEEZE и SHELXL устраняют ряд избыточных сложностей, присущих прежней реализации процедуры SQUEEZE. Ранее эти сложности были необходимы, поскольку уточнение методом наименьших квадратов с использованием ныне заменённой программы SHELXL97 не допускало ввода фиксированных внешних вкладов в расчёт структурных факторов. Теперь для выполнения уточнения в SHELXL больше не требуется временно вычитать вклад растворителя из наблюдаемых интенсивностей: при использовании инструкции ABIN программа принимает вклад растворителя из внешнего файла (.fab). Кроме того, с помощью SQUEEZE теперь можно обрабатывать многие двойниковые структуры, содержащие разупорядоченный растворитель. Подробности расчёта SQUEEZE автоматически включаются в архивный файл CIF вместе с необъединёнными данными отражений. Описана современная реализация процедуры SQUEEZE, которая также рассмотрена и проиллюстрирована на трёх примерах. Два примера основаны на данных отражений опубликованных структур, а один — на синтетических данных отражений, сгенерированных для опубликованной структуры.