Внеклеточный матрикс: инструменты и новые представления в эпоху омиксных технологий

Внеклеточный матрикс (ВКМ) — важнейший компонент многоклеточных организмов. Он обеспечивает механические и химические сигналы, определяющие организацию и функционирование клеток и тканей. Разрушение ВКМ, его избыточное образование или изменение состава вызывают или сопровождают многочисленные патологические процессы. Поэтому более подробная характеристика состава, метаболизма и биологии ВКМ может помочь выявить новые прогностические и диагностические маркеры, а также возможности для терапии. Развитие высокопроизводительных омиксных методов за последние годы значительно ускорило исследования в области наук о жизни. В этом обзоре описаны новые биоинформатические инструменты и экспериментальные подходы к изучению ВКМ, а также показано, как они помогают углубить понимание его биологии. Авторы также представляют веб-платформу The Matrisome Project и базу данных MatrisomeDB, объединяющую данные компьютерного анализа и исследований in vivo о матрисоме — совокупности генов, кодирующих белки ВКМ и ассоциированные с ним белки. Наконец, представлен первый вариант атласа ВКМ, составленный на основе протеомных данных о его составе в 14 типах тканей и опухолей.