Активность 20S-протеасомы человека в отношении флуорогенных пептидов различной длины

Протеасома представляет собой мультикаталитическую протеазу, ответственную за деградацию неправильно свернутых белков. Мы синтезировали флуорогенные субстраты, в которых длину пептидной цепи последовательно увеличивали от двух до шести аминокислот, и оценили влияние длины пептида на все три вида каталитической активности 20S-протеасомы человека. Для пептидов из пяти и шести аминокислот мы также синтезировали библиотеки флуорогенных субстратов. Кинетический анализ показал, что субстраты из шести аминокислот значительно эффективнее коротких пептидных субстратов для химотрипсиноподобной и каспазоподобной активности. Для трипсиноподобной активности оптимальным оказался субстрат из пяти аминокислот.