Переклассификация Clostridium difficile в Clostridioides difficile (Hall and O'Toole 1935) Prévot 1938

Недавнее предложение Lawson и Rainey (2015) ограничить род Clostridium видом Clostridium butyricum и родственными видами затрагивает представителей других родов, не входящих в эту кладу: их не следует относить к Clostridium sensu stricto. Один из таких микроорганизмов, имеющий большое медицинское значение, — Clostridioides difficile, одна из основных причин внутрибольничной диареи и смертности пациентов. Согласно анализу последовательностей гена 16S рРНК, ближайший родственник Clostridium difficile — Clostridium mangenotii; сходство последовательностей составляет 94,7%. Оба вида относятся к семейству Peptostreptococcaceae, филогенетически далёкому от C. butyricum и других представителей Clostridium sensu stricto. При выращивании в бульоне PYG Clostridium difficile и Clostridium mangenotii образуют большое количество водорода, а также широкий спектр насыщенных и ненасыщенных жирных кислот с прямой и разветвлённой цепью; основной продукт — C16:0. Диагностической диаминокислотой в пептидогликане клеточной стенки является meso-DAP. На основании фенотипического, хемотаксономического и филогенетического анализа предлагается новый род Clostridioides, к которому Clostridium difficile переносится под названием Clostridioides difficile gen. nov., comb. nov.; Clostridium mangenotii также переносится в этот род как Clostridioides mangenotii comb. nov. Типовой вид рода Clostridioides — Clostridioides difficile.