Mesorhizobium delmotii и Mesorhizobium prunaredense — два новых вида, к которым относятся штаммы ризобий симбиовара anthyllidis

Изучены восемь симбиотических штаммов мезоризобий, выделенных из корневых клубеньков Anthyllis vulneraria, и проведено их таксономическое сравнение с описанными видами рода Mesorhizobium. Последовательности гена 16S рРНК у всех штаммов были идентичны, однако штаммы можно было различить с помощью многолокусного секвенирования генов домашнего хозяйства recA, atpD, glnII и dnaK. По результатам масс-спектрометрии с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией и времяпролётным анализом (MALDI-TOF) штаммы разделились на две группы и один отдельный штамм. Степень ДНК-ДНК-гибридизации между представительными штаммами и наиболее близкими родственными видами Mesorhizobium, использованными в качестве референсных, составила менее 55%. Проведена дальнейшая фенотипическая характеристика двух групп, включавших соответственно четыре и три штамма из районов Севенн, прилегающих к горнодобывающим объектам, и районов без горных разработок. Разделение на группы было подтверждено также значениями средней нуклеотидной идентичности, рассчитанными на основе секвенирования геномов: они составляли 80–92% при сравнении с близкородственными видами и между группами, подтверждая, что эти группы представляют новые виды Mesorhizobium. Предложены два новых вида: Mesorhizobium delmotii sp. nov. (типовой штамм STM4623=LMG 29640=CFBP 8436) и Mesorhizobium prunaredense sp. nov. (типовой штамм STM4891=LMG 29641=CFBP 8437). Типовые штаммы обоих предлагаемых видов имеют общие вспомогательные гены клубенькообразования и относятся к новому симбиовару anthyllidis, как и типовой штамм Mesorhizobium metallidurans. TTTTTT