Разнообразие, классификация и эволюция систем CRISPR-Cas

Бактериальные и архейные системы адаптивного иммунитета CRISPR-Cas отличаются большим разнообразием состава белков, структуры эффекторных комплексов, архитектуры геномных локусов и механизмов адаптации, процессинга предшественника crRNA (pre-crRNA) и интерференции. Системы CRISPR-Cas подразделяются на два класса: класс 1 включает многокомпонентные эффекторные комплексы, а класс 2 — эффекторные модули, состоящие из одного белка. Комплексные геномные и экспериментальные исследования систем CRISPR-Cas класса 2 позволили выявить два новых типа и несколько подтипов. Системы типа VI — первые среди вариантов CRISPR-Cas, мишенью которых служит исключительно РНК. Неожиданно оказалось, что в некоторых системах класса 2 эффекторный белок также отвечает за процессинг pre-crRNA. Сравнительный анализ эффекторных комплексов указывает на то, что системы класса 2 неоднократно и независимо возникали из мобильных генетических элементов.