Современные разработки и применения метода MMPBSA

Метод молекулярной механики—уравнений Пуассона—Больцмана и площади доступной поверхности (MMPBSA) широко применяют как эффективный и надёжный метод моделирования свободной энергии для изучения молекулярного распознавания, в частности взаимодействия белков с лигандами. В этом обзоре рассматриваются современные разработки и применения метода MMPBSA. Обзор методологии охватывает сольватационные слагаемые, энтропийный член, расширение метода на мембранные белки и высокоскоростной скрининг, а также новые наборы средств автоматизации. Кроме того, рассмотрены недавние применения метода в различных важных областях биомедицины и химии. В заключение обозначены несколько перспективных направлений, призванных сделать MMPBSA более надёжным и эффективным методом.