Регуляция естественной компетентности и секреции типа VI у Vibrio cholerae, зависимая от QstR

При росте на хитинсодержащих поверхностях в естественной водной среде Vibrio cholerae приобретает естественную компетентность к трансформации и уничтожает соседние бактерии, не обладающие иммунитетом, с помощью системы секреции типа VI (T6SS). Активация этих двух фенотипов требует индуцируемого хитином регулятора TfoX, но также зависит от сигналов системы кворум-сенсинга, поступающих через промежуточный регулятор QstR, относящийся к семейству регуляторов типа LuxR. В настоящем исследовании с помощью секвенирования РНК определён регулон QstR. Кроме того, картирование участков связывания QstR методом иммунопреципитации хроматина с последующим глубоким секвенированием показало, что QstR является транскрипционным фактором, связывающимся с участками ДНК перед генами, экспрессия которых повышается или снижается. Как и функция других транскрипционных регуляторов семейства LuxR, функция QstR зависит от димеризации. Однако, в отличие от хорошо изученного регулятора биоплёнки VpsT у V. cholerae, для которого необходим вторичный посредник c-di-GMP, димеризация и функция QstR не зависят от c-di-GMP. Неожиданно оказалось, что, хотя ComEA — периплазматический ДНК-связывающий белок, необходимый для трансформации — синтезируется зависимым от QstR образом, связывания QstR в области перед comEA не выявлено, что указывает на существование дополнительного регуляторного пути. В целом эти результаты подробно раскрывают функцию ключевого регулятора естественной компетентности и секреции типа VI у V. cholerae.