Новые инструменты для автоматизированного определения криоэлектронно-микроскопических структур высокого разрешения в RELION-3
New tools for automated high-resolution cryo-EM structure determination in RELION-3
Аннотация
Описан третий крупный выпуск RELION. В дополнение к поддержке GPU реализовано векторное ускорение вычислений на CPU, что повышает гибкость использования ресурсов и устраняет ограничения по объёму памяти. Автоматический выбор частиц без эталона с применением фильтра Лапласа—Гаусса и запуск задач из Python позволяют выполнять обработку без участия оператора непосредственно во время сбора данных, включая 2D-классификацию, построение моделей и 3D-классификацию. Уточнение параметров CTF для каждой частицы и коррекция оценённого наклона пучка повышают разрешение реконструкций, когда частицы находятся на разной высоте во льду и/или выравнивание без комы выполнено неоптимально. Коррекция кривизны сферы Эвальда улучшает разрешение для крупных частиц. Эти разработки проиллюстрированы общедоступными наборами данных: в сочетании с байесовским подходом к коррекции движения, вызванного воздействием пучка, они обеспечивают улучшение разрешения на 0,2–0,7 Å по сравнению с предыдущими версиями RELION. de novo
Переведем эту статью за 1 час
Загрузите PDF, а мы сделаем полный перевод, краткий конспект и красивую инфографику.
Попробовать бесплатно →Также в Подтеме: еженедельные литобзоры, база международных клинреков и конспекты свежих мед. статей и подкастов каждый день.