Разнообразие подтипов ВИЧ в мире

Цель обзора: представить сводку актуальных данных о глобальном разнообразии подтипов ВИЧ и их региональном распределении. ВИЧ относится к числу наиболее генетически разнообразных патогенов вследствие высокой частоты мутаций и рекомбинаций, большой численности популяции и быстрого темпа репликации. Этот быстрый эволюционный процесс привёл к появлению нескольких подтипов ВИЧ, неравномерно распределённых по миру.

Последние данные: подтип A по-прежнему наиболее распространён в отдельных регионах Восточной Африки, России и стран бывшего Советского Союза; подтип B — в Европе, Америке и Океании; подтип C — в Южной Африке и Индии; CRF01_AE — в Азии, а CRF02_AG — в Западной Африке. Недавние исследования, основанные на секвенировании почти полноразмерного генома, подчеркнули возрастающее значение рекомбинантных вариантов и вирусов подтипа C.

Краткое содержание: динамика распределения подтипов ВИЧ создаёт будущие трудности для диагностики, лечения и разработки вакцин. Увеличение числа рекомбинантных вирусов указывает на то, что коинфекция и суперинфекция различающимися штаммами ВИЧ стали более частыми, что требует постоянного эпиднадзора для отслеживания вирусного разнообразия. Более дешёвые подходы к секвенированию почти полноразмерного генома имеют решающее значение для улучшения оценки подтипов ВИЧ. Однако отсутствие данных о подтипах и низкий уровень выборочного секвенирования по-прежнему остаются проблемой в некоторых географических регионах.