Частые, промежуточные и хорошо документированные HLA-аллели в мировых популяциях: версия CIWD 3.0.0

Составлен каталог частых, промежуточных и хорошо документированных (CIWD) аллелей HLA-A, -B, -C, -DRB1, -DRB3, -DRB4, -DRB5, -DQB1 и -DPB1 на основе данных более чем 8 миллионов человек из 20 не связанных между собой регистров доноров-добровольцев гемопоэтических стволовых клеток. Участники были разделены на семь географических, родственных и этнических групп; данные представлены отдельно для каждой группы и для общей популяции.

Назначения P-групп (двухполевая номенклатура) и G-групп распределяли по четырем категориям частоты: частые (≥1 на 10 000), промежуточные (≥1 на 100 000), хорошо документированные (≥5 наблюдений) и не относящиеся к CIWD. В целом 26% аллелей в базе IPD-IMGT/HLA версии 3.31.0 на уровне P-групп относятся к трем категориям CIWD. В каталоге по двухполевой номенклатуре 18% (n = 545) аллелей были частыми, 17% (n = 513) — промежуточными и 65% (n = 1997) — хорошо документированными. Данные по частоте аллелей в полном формате представлены, но их ценность ограничена различиями в уровне разрешения, использовавшемся в регистрах. Рекомендуемый список CIWD основан на наиболее частой категории в общей выборке или в любой из семи географических, родственных и этнических групп. Также приведены данные, позволяющие пользователям составлять каталог, специфичный для тех популяционных групп, с которыми они работают. Проведено сравнение с тремя предыдущими отчетами CWD, основанными на более ограниченных популяционных группах. Этот каталог, CIWD версии 3.0.0, приближает создание глобального свода частот HLA и более ясное понимание HLA-разнообразия в человеческой популяции в целом.