Обновлённая классификация триб семейства Яснотковые на основе филогеномики пластома

Введение: Надёжная молекулярная филогения необходима для создания стабильной классификации и формирования прочной основы для изучения закономерностей диверсификации, исторической биогеографии и эволюции признаков. Семейство Яснотковые (Lamiaceae), шестое по числу видов среди покрытосеменных, служит важным источником эфирных масел, древесины, декоративных растений, а также пряных и лекарственных трав, что делает его исключительно значимой группой в экологическом, этноботаническом и флористическом отношении. До настоящего времени отсутствие надёжной филогенетической основы препятствовало широкомасштабным биогеографическим исследованиям и пониманию процессов диверсификации. Несмотря на значительный прогресс в изучении родственных связей внутри семейства за последние три десятилетия, реконструкция филогенетического каркаса на уровне триб оставалась одной из наиболее сложных задач из-за ограниченного объёма генетических данных.

Результаты: Мы провели филогенетический анализ семейства Яснотковые для определения родственных связей на уровне триб, используя 79 белок-кодирующих генов пластома из 175 образцов, представляющих 170 таксонов, 79 родов и все 12 подсемейств. Анализы методом максимального правдоподобия и байесовский анализ дали более надёжную филогенетическую гипотезу по сравнению с предыдущими исследованиями и подтвердили монофилию всех 12 подсемейств, а также классификацию семейства на 22 трибы, три из которых предложены в настоящем исследовании впервые. В связи с этим мы предлагаем обновлённую филогенетически обоснованную классификацию триб семейства Яснотковые, дополненную подробным обзором таксономической истории, разнообразия родов и видов, морфологии, синапоморфий и распространения каждого подсемейства и трибы.

Выводы: Увеличение таксономического охвата в сочетании с филогенетическим анализом последовательностей пластома обеспечило надёжную поддержку как глубоких, так и терминальных узлов и позволило получить новые сведения о филогенетических связях между трибами и подсемействами семейства Яснотковые. Этот надёжный филогенетический каркас послужит основой для дальнейших исследований классификации яснотковых, биогеографии, эволюции признаков и диверсификации.