Паттерны программ факторов транскрипции и активации иммунных путей определяют четыре основных подтипа мелкоклеточного рака лёгкого с различными терапевтическими уязвимостями

Несмотря на молекулярную и клиническую гетерогенность, мелкоклеточный рак лёгкого (МРЛ) лечат как единое заболевание, при этом результаты лечения остаются ожидаемо неблагоприятными. На основании данных об экспрессии генов в опухолевой ткани и неотрицательной матричной факторизации мы выделили четыре подтипа МРЛ. Они определяются преимущественно различиями в экспрессии факторов транскрипции ASCL1, NEUROD1 и POU2F3 либо низкой экспрессией всех трёх сигнатур факторов транскрипции в сочетании с сигнатурой воспалительного ответа; подтипы обозначены SCLC-A, SCLC-N, SCLC-P и SCLC-I соответственно. Наибольшую пользу от добавления иммунотерапии к химиотерапии получают пациенты с SCLC-I. Для остальных подтипов характерны свои уязвимости, в том числе к ингибиторам PARP, киназ Aurora и BCL-2. В ксенотрансплантатах опухолей пациентов с SCLC-A лечение цисплатином вызывает внутритуморальный сдвиг в сторону SCLC-I, что подтверждает смену подтипа как возможный механизм приобретённой устойчивости к препаратам платины. Подбор терапии с учётом исходного подтипа опухоли и управление сменой подтипа во время лечения могут повысить глубину и продолжительность ответа у пациентов с МРЛ.