Культура-независимый подход к изучению роли почвенных грибных сообществ в выпадении травостоя костра кровельного

Костёр кровельный (Bromus tectorum L.) — инвазивный однолетний злак семейства Poaceae, распространившийся на значительной части межгорного запада США. В разных районах его распространения наблюдалось выпадение травостоя; возможная причина — присутствие в почве или поверхностной подстилке нескольких видов грибов-патогенов. В этом исследовании с применением метабаркодирования сравнили грибные сообщества на участках, где выпадение травостоя наблюдалось и не наблюдалось. Образцы почвы и поверхностной подстилки собрали неподалёку от Уиннемукки (Невада) и в долине Скалл-Вэлли (Юта). Результаты показали, что состав грибных сообществ при выпадении травостоя различался в зависимости от географического положения и типа образца. В поверхностной подстилке в обоих районах — Уиннемукке и Скалл-Вэлли — в образцах с участков с выпадением травостоя была выше представленность эндофита Ramimonilia apicalis. В поверхностной подстилке с таких участков в Уиннемукке также чаще встречался потенциальный патоген рода Comoclathris. В поверхностной подстилке с участков с выпадением травостоя в Скалл-Вэлли была выше представленность неописанного вида семейства Rustroemiaceae, вызывающего так называемый синдром обесцвечивания у костра кровельного; в почве чаще встречались потенциальные патогены родов Olpidium и Monosporascus.