Новая сигнатура генов, связанных с пироптозом, для прогнозирования прогноза при раке яичников

Рак яичников — злокачественная опухоль с крайне неблагоприятным прогнозом. В последние годы пироптоз был описан как воспалительная форма программируемой клеточной смерти. Однако экспрессия генов, связанных с пироптозом, при раке яичников и её связь с прогнозом остаются неясными. В этом исследовании выявили 31 регулятор пироптоза, экспрессия которых различалась в тканях рака яичников и нормальных тканях яичников. На основании этих дифференциально экспрессируемых генов все случаи рака яичников разделили на два подтипа. Прогностическую ценность каждого гена, связанного с пироптозом, оценили в когорте проекта The Cancer Genome Atlas (TCGA) и использовали для построения многогенной сигнатуры. С помощью метода регрессии Кокса с оператором наименьшего абсолютного сжатия и отбора (LASSO) создали сигнатуру из семи генов, которая разделила всех пациентов с раком яичников в когорте TCGA на группы низкого и высокого риска. Вероятность выживания пациентов из группы низкого риска была значительно выше, чем в группе высокого риска (P < 0,001). Используя медианное значение оценки риска в когорте TCGA, пациентов с раком яичников из когорты Gene Expression Omnibus (GEO) также разделили на две группы риска; общая выживаемость в группе низкого риска была выше (P = 0,014). С учётом клинических характеристик оценка риска оказалась независимым фактором прогноза общей выживаемости пациентов с раком яичников. Анализ онтологии генов (GO) и базы данных Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) показал обогащение генами, связанными с иммунитетом, и снижение иммунной активности в группе высокого риска. Таким образом, гены, связанные с пироптозом, играют важную роль в противоопухолевом иммунитете и могут использоваться для прогнозирования исхода рака яичников.