Интерактивное дерево жизни (iTOL) v5: онлайн-инструмент для визуализации и аннотирования филогенетических деревьев
Interactive Tree Of Life (iTOL) v5: an online tool for phylogenetic tree display and annotation
Аннотация
Интерактивное дерево жизни (https://itol.embl.de) — онлайн-инструмент для визуализации, редактирования и аннотирования филогенетических и других деревьев. Он находится в свободном доступе для всех пользователей. В версии iTOL 5 полностью переработан механизм визуализации деревьев и добавлено множество новых функций. В частности, появился новый тип набора данных — мотивы MEME, а возможности аннотирования для ряда уже существующих типов были расширены. Расширены и возможности отображения метаданных узлов: теперь поддерживаются категориальные значения, не являющиеся числовыми, а также несколько значений для одного узла. Стала доступна прямая ручная аннотация — набор базовых инструментов для рисования и нанесения подписей, позволяющий вручную добавлять к деревьям фигуры, подписи и другие элементы. Расширена поддержка шкал деревьев и наборов данных, что обеспечивает тонкую настройку стилей линий и подписей. При визуализации некорневых деревьев теперь можно использовать алгоритм равномерного распределения свободного пространства, значительно повышающий наглядность. Система учётных записей пользователей была упрощена и расширена новыми возможностями навигации; в настоящее время она поддерживает более 1 млн деревьев, загруженных более чем 70 000 пользователей.
Переведем эту статью за 1 час
Загрузите PDF, а мы сделаем полный перевод, краткий конспект и красивую инфографику.
Попробовать бесплатно →Также в Подтеме: еженедельные литобзоры, база международных клинреков и конспекты свежих мед. статей и подкастов каждый день.