Научная статья

Интерактивное дерево жизни (iTOL) v5: онлайн-инструмент для визуализации и аннотирования филогенетических деревьев

Interactive Tree Of Life (iTOL) v5: an online tool for phylogenetic tree display and annotation

Nucleic Acids Research
10.1093/nar/gkab301
Полный текст Открыть в журнале PubMed PMC
FWCI: 694FWCI — Field-Weighted Citation Impact (индекс цитируемости с поправкой на область науки). 1.0 = среднее, > 1 = выше среднего · Процитировано: 10912 · Ссылки: 16 · Лицензия: CC-BY
Цитирование по годам: 2026: 1292 · 2025: 2386 · 2024: 3565 · 2023: 2742 · 2022: 1773

Аннотация

Интерактивное дерево жизни (https://itol.embl.de) — онлайн-инструмент для визуализации, редактирования и аннотирования филогенетических и других деревьев. Он находится в свободном доступе для всех пользователей. В версии iTOL 5 полностью переработан механизм визуализации деревьев и добавлено множество новых функций. В частности, появился новый тип набора данных — мотивы MEME, а возможности аннотирования для ряда уже существующих типов были расширены. Расширены и возможности отображения метаданных узлов: теперь поддерживаются категориальные значения, не являющиеся числовыми, а также несколько значений для одного узла. Стала доступна прямая ручная аннотация — набор базовых инструментов для рисования и нанесения подписей, позволяющий вручную добавлять к деревьям фигуры, подписи и другие элементы. Расширена поддержка шкал деревьев и наборов данных, что обеспечивает тонкую настройку стилей линий и подписей. При визуализации некорневых деревьев теперь можно использовать алгоритм равномерного распределения свободного пространства, значительно повышающий наглядность. Система учётных записей пользователей была упрощена и расширена новыми возможностями навигации; в настоящее время она поддерживает более 1 млн деревьев, загруженных более чем 70 000 пользователей.

Переведем эту статью за 1 час

Загрузите PDF, а мы сделаем полный перевод, краткий конспект и красивую инфографику.

Попробовать бесплатно →

Также в Подтеме: еженедельные литобзоры, база международных клинреков и конспекты свежих мед. статей и подкастов каждый день.