Роль трансляции кольцевых РНК в онкологических заболеваниях

Кольцевые РНК (circRNAs) представляют собой класс ковалентно замкнутых молекул РНК. С постоянным развитием технологий высокопроизводительного секвенирования и биоинформатических инструментов было выявлено множество circRNAs в различных тканях и клеточных линиях человека. Примечательно, что недавние исследования показали: некоторые circRNAs обладают трансляционной функцией. Независимый от кэпа механизм трансляции опосредуется сайтами внутреннего входа рибосомы и модификацией N6-метиладенозина. В данном обзоре описаны эти два механизма трансляции и методы их верификации на молекулярном уровне. Для анализа структурных признаков, указывающих на потенциальную трансляцию circRNAs, использовались базы данных, включая ORF Finder, Pfam, BLASTp, CircRNADb, CircBase, CircPro, CircCode, IRESite и IRESbase. Система минигена circRNA с репортером на основе зеленого флуоресцентного белка (GFP) подтвердила трансляционный потенциал circRNAs. Кроме того, кратко суммированы роли белков/пептидов, кодируемых circRNAs (circFBXW7, circFNDC3B, circLgr4, circPPP1R12A, circMAPK1, circβ-catenin, circGprc5a, circ-SHPRH, circPINTexon2, circAKT3), которые к настоящему времени верифицированы при раке человека: тройном негативном раке молочной железы, раке ободочной кишки, раке желудка, гепатоцеллюлярной карциноме, раке мочевого пузыря и глиобластоме. Эти данные указывают на существенное значение circRNAs для трансляции генома человека.