Обновление BUSCO: новые и оптимизированные конвейеры анализа, расширение и углубление филогенетического охвата для оценки геномов эукариот, прокариот и вирусов

Методы оценки качества геномных и метагеномных данных необходимы для улучшения сборки геномов и правильной интерпретации результатов последующего анализа. BUSCO оценивает полноту и избыточность обработанных геномных данных на основе универсальных однокопийных ортологов. В этой работе представлены новые функции и существенные улучшения программного обеспечения BUSCO, а также обновлённые и расширенные наборы данных, синхронизированные с выпуском OrthoDB v10. Среди основных нововведений — возможность определять филогенетическое положение входной последовательности и автоматически выбирать наиболее подходящий набор данных BUSCO для оценки, что позволяет анализировать геномы, собранные из метагеномных данных, даже если их происхождение неизвестно. Новый конвейер анализа геномов повышает эффективность и сокращает время обработки, особенно для крупных геномов эукариот. BUSCO — единственный инструмент, позволяющий оценивать виды как эукариот, так и прокариот; он применим к различным типам данных: сборкам геномов, метагеномным бинам, транскриптомам и наборам генов.