Характеристика нового варианта SARS-CoV-2 B.1.621, представляющего интерес

Генетическое разнообразие коронавируса тяжёлого острого респираторного синдрома 2 (SARS-CoV-2) может влиять на его контагиозность и способность избегать нейтрализующих антител, вырабатывающихся после естественной инфекции или вакцинации. Для секвенирования генома и определения линии репрезентативных образцов циркулировавшего в Колумбии SARS-CoV-2, собранных с января по апрель 2021 года, применили протокол сети ARTIC для ампликонного секвенирования на платформе Nanopore и конвейер PANGOLIN. Это позволило выявить появление линии B.1.621, отнесённой к вариантам, представляющим интерес. В ней накопилось несколько замен, затрагивающих белок Spike: I95I, Y144T, Y145S и вставка N в положении 146 в N-концевом домене; R346K, E484K и N501Y в рецептор-связывающем домене (RBD); P681H в сайте расщепления S1/S2. Быстрый рост частоты этой линии и её закрепление за относительно короткое время в Магдалене, Атлантико, Боливаре, Боготе (столичном округе) и Сантандере, где теоретический уровень коллективного иммунитета был близок к достижению, указывают на возможное эпидемиологическое значение варианта. Для оценки биологических и эпидемиологических последствий выявленного набора замен в линии B.1.621 необходимы дальнейшие исследования.