Развитие меланоцитов человека и дедифференцировка меланомы на уровне отдельных клеток

У человека эпидермальные меланоциты отвечают за пигментацию кожи, защиту от ультрафиолетового излучения и развитие меланомы — самого смертоносного распространённого рака кожи. Хотя пути развития меланоцитов у разных модельных организмов во многом сходны, видовые различия встречаются часто, а сохранение этих процессов в коже человека остаётся неясным. Мы использовали методику обогащения отдельных клеток и секвенирования РНК, чтобы непосредственно изучить эпидермальные меланоциты человека в коже, получив транскриптомы из различных анатомических зон у лиц разного возраста, пола и с разными оттенками кожи. Мы выявили субпопуляции меланоцитов, обогащённые в определённых анатомических зонах; это разделение формируется во время внутриутробного развития и сохраняется во взрослом возрасте. Транскрипционный профиль субпопуляции, обогащённой в коже ладонной и подошвенной поверхностей, сохраняется при акральной меланоме. Кроме того, мы выявили транскрипционные программы дифференцировки меланоцитов человека, отличающиеся от генных сигнатур, полученных в модельных системах. Наконец, с помощью этих программ мы определили паттерны дедифференцировки, позволяющие прогнозировать исход меланомы и ответ на терапию ингибиторами иммунных контрольных точек.