NPClassifier: инструмент классификации структур природных соединений на основе глубокой нейронной сети

Вычислительные подходы, такие как анализ генома и метаболома, становятся необходимыми для изучения природных соединений. Поэтому требуется автоматизированная система классификации типов структур, способная обрабатывать огромные объёмы данных о структурах природных соединений. Оптимальная семантическая онтология для классификации природных соединений должна учитывать не только наличие или отсутствие химических субструктур, но и таксономическую принадлежность организма-продуцента, особенности биосинтетического пути и/или биологические свойства соединений. Таким образом, целостная автоматизированная система классификации природных соединений может существенно облегчить комплексный анализ взаимосвязей между ними, особенно при работе с большими массивами данных. В настоящей работе представлен NPClassifier — инструмент на основе глубокого обучения для автоматической классификации структур природных соединений по отпечаткам Моргана, учитывающим количество фрагментов. Ожидается, что NPClassifier ускорит и повысит эффективность поиска природных соединений, связывая их структуры с лежащими в основе свойствами.