Одноклеточный атлас развития лёгких у мыши

Для органогенеза лёгких необходимы точные временная координация процессов и пространственная организация паренхиматозных клеток, обеспечивающие их функцию. Чтобы систематически изучить механизмы динамических изменений паренхиматозных клеток в ключевые периоды развития, мы провели временное исследование с помощью одно-клеточного секвенирования РНК. В него вошли 102 571 эпителиальная, эндотелиальная и мезенхимальная клетка, полученная в девять сроков — с 12-го дня эмбрионального развития до 14-го дня после рождения у мышей. Сочетая вычислительное прогнозирование вероятности клеточной судьбы с гибридизацией РНК in situ и иммунофлуоресцентным окрашиванием, мы изучили связи между клеточными линиями при переходе от саккулярной стадии к альвеолярной. Возможности этого общедоступного атласа с поиском (www.sucrelab.org/lungcells) иллюстрируют обнаруженные нами разнообразие функций пневмоцитов I типа и особенности экспрессии Wnt в мезенхиме на саккулярной и альвеолярной стадиях — периодах значительного увеличения площади поверхности газообмена. Мы представляем целостную картину динамики эпителиальных, эндотелиальных и мезенхимальных клеток в ходе органогенеза лёгких.