Факторы, определяющие содержание генов устойчивости к противомикробным препаратам в пыли на 333 птицеводческих и свиноводческих фермах в девяти странах Европы

Фекалии сельскохозяйственных животных, содержащие бактерии, устойчивые к противомикробным препаратам, попадают на полы помещений, в навозные хранилища и на сельскохозяйственные угодья, а затем распространяются в окружающую среду со стоками и аэрозолями. Роль пыли в распространении устойчивости к противомикробным препаратам (УПП) на фермах изучена мало. Концентрации генов устойчивости к противомикробным препаратам (ГУП) в фермерской пыли и факторы, потенциально влияющие на них, пока неизвестны. В этом исследовании с помощью количественной ПЦР измеряли абсолютное содержание ГУП в воздушной пыли, отражающее уровень воздействия на людей и животных, а также относительную представленность ГУП, отражающую их долю в бактериальной популяции. Исследовали четыре ГУП в 947 образцах свежевыпавшей пыли, собранных с помощью электростатических пылесборников (EDC) на 174 фермах по выращиванию бройлеров и 159 свиноводческих фермах в девяти странах Европы. С помощью линейных моделей со смешанными эффектами оценили связи с содержанием ГУП в фекалиях, применением противомикробных препаратов (ПМП), а также характеристиками ферм и животных. Относительная представленность ГУП в пыли была сходной с таковой в фекалиях; между этими резервуарами выявлена значимая положительная связь (r от 0,21 до 0,82). У свиней применение ПМП было положительно связано с представленностью ГУП в пыли тех же помещений. Более высокий уровень биобезопасности был связан с меньшей относительной представленностью ГУП в пыли на птицеводческих фермах и с большей — на свиноводческих. Абсолютное содержание ГУП в пыли было ниже, в частности, летом и при использовании некоторых видов подстилки на птицеводческих фермах, а на свиноводческих — при меньшей плотности животных и летом. Результаты указывают на различные механизмы формирования резистома пыли в животноводческих хозяйствах: одни связаны с образованием пыли, другие влияют на бактериальное сообщество. Пыль на фермах служит крупным резервуаром ГУП, откуда они потенциально могут передаваться бактериям в других резервуарах. Выявленные факторы, связанные с представленностью ГУП в фермерской пыли, могут стать основой для дальнейших исследований и, возможно, повлиять на разработку мер управления фермерскими хозяйствами.