Метаанализ выявляет как согласованность, так и взаимодополняемость ДНК- и eDNA-метабаркодирования с традиционными методами оценки биологических сообществ

Метабаркодирование ДНК всё шире применяют для оценки водных сообществ, и многочисленные исследования изучали согласованность этого метода с традиционными морфотаксономическими подходами. В этих исследованиях, проведённых за последнее десятилетие в морских и пресноводных системах по всему миру, с помощью метабаркодирования ДНК оценивали разнообразие и структуру сообществ водных организмов. Однако до сих пор отсутствовал систематический анализ сопоставимости и эффективности ДНК-методов оценки сообществ по совокупности этих исследований. Мы выполнили первый метаанализ доступных работ, в которых традиционные методы сравнивали с метабаркодированием ДНК для измерения и оценки биологического разнообразия основных групп водных организмов, включая планктон, микрофитобентос, макробеспозвоночных и рыб. На основании 215 наборов данных установлено, что оценки видового богатства, полученные с помощью метабаркодирования ДНК, в целом согласуются с результатами традиционных методов как на локальном, так и на региональном уровне. При оценке рыб метабаркодирование ДНК также формирует видовые списки, в высокой степени совпадающие с полученными традиционными методами. Напротив, видовые списки планктона, микрофитобентоса и макробеспозвоночных, составленные с помощью метабаркодирования ДНК, существенно отличались от результатов традиционных методов: некоторые таксоны оставались невыявленными, но одновременно обнаруживалось ранее не выявленное разнообразие. В целом метод уже достаточно развит для изучения состава сообществ рыб и может заменить более инвазивные традиционные методы. Для мелких организмов, таких как макробеспозвоночные, планктон и микрофитобентос, метабаркодирование ДНК, вероятно, будет давать взаимодополняющие, а не идентичные оценки по сравнению с традиционными подходами. Систематический сбор сопоставимых данных позволит лучше понять различные аспекты этой взаимодополняемости, повысить эффективность метода и улучшить интерпретацию результатов.