Быстрое выявление вируса мозаики земляники методом амплификации рекомбиназной полимеразой с обратной транскрипцией и использованием тест-полоски латерального потока

Вирус мозаики земляники (SMoV) — один из основных РНК-содержащих вирусов, существенно нарушающих рост земляники во всем мире. Описанный метод быстрого выявления SMoV непосредственно на месте может применяться для получения безвирусного посадочного материала земляники. Для быстрого выявления SMoV амплификацию рекомбиназной полимеразой с обратной транскрипцией (RT-RPA) сочетали с детекцией на тест-полоске латерального потока (LF). В оптимизированных условиях предел обнаружения составлял 500 фг РНК. Оптимальные параметры анализа SMoV-RT-RPA-LF включали 2 мкл обратного праймера (5 мкМ) и 0,6 мкл зонда (10 мкМ) в реакционной смеси RT-RPA объемом 50 мкл; изотермическую амплификацию проводили при 40 °C в течение 15 мин. Кроме того, в различных районах пригородов Шанхая были собраны 100 образцов, подозрительных на заражение. С помощью анализа SMoV-RT-RPA-LF вирус выявлен в 3 из 100 образцов, что хорошо согласовывалось с результатами полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР). Праймеры и зонд обладали высокой специфичностью к SMoV: перекрёстной реакции с другими вирусами земляники не выявлено. Результаты исследования демонстрируют эффективность метода быстрого выявления SMoV непосредственно на месте для обеспечения производства безвирусного посадочного материала земляники.