Идентификация двойников в данных одно-клеточного секвенирования с помощью scDblFinder

Двойники часто встречаются в данных одно-клеточного секвенирования и могут приводить к артефактным результатам. Поэтому были предложены различные подходы для их выявления. Опираясь на сильные стороны существующих методов, мы разработали быстрый, гибкий и точный метод обнаружения двойников на основе Bioconductor. Здесь мы представляем этот метод, обосновываем выбранные решения, демонстрируем его эффективность как на данных одно-клеточного секвенирования РНК, так и на данных секвенирования доступности хроматина (ATAC), а также приводим некоторые наблюдения о формировании двойников, их выявлении и анализе обогащения. Даже в сложных наборах данных метод может точно идентифицировать большинство гетеротипических двойников и в независимом сравнительном исследовании уже показал превосходство над альтернативами.