Mesorhizobium ventifaucium sp. nov. и Mesorhizobium escarrei sp. nov. — два новых клубеньковых вида, выделенных из Anthyllis vulneraria

Для уточнения таксономического положения изучили десять мезоризобиальных штаммов, выделенных из корневых клубеньков Anthyllis vulneraria методом приманочных растений с использованием почв из южной Франции. Последовательности 16S рДНК у всех штаммов были идентичны и указывали на их принадлежность к роду Mesorhizobium и группе видов M. prunaredense, M. delmotii, M. temperatum, M. mediterraneum и M. wenxiniae; ближайшим описанным видом оказался M. robiniae. Эволюционные связи с валидно описанными видами дополнительно изучили методом многолокусного анализа последовательностей (MLSA) четырёх генов домашнего хозяйства, кодирующих белки (recA, atpD, glnII и dnaK). Анализ разделил штаммы на две группы и позволил предположить, что они относятся к двум разным видам. Эти результаты получили подтверждение при анализе методом масс-спектрометрии MALDI-TOF, лабораторной ДНК-ДНК-гибридизации (≤58%) и с помощью геномных методов разграничения видов (ANI < 96%, ДНК-ДНК-гибридизация in silico < 70%), что подтвердило принадлежность штаммов к двум новым видам. С учётом выявленных различий для этих видов предложены названия Mesorhizobium ventifaucium (STM4922 = LMG 29643 = CFBP 8438) и Mesorhizobium escarrei (типовой штамм STM5069 = LMG 29642 = CFBP 8439). Филогения генов nodC и nodA, участвующих в образовании клубеньков, отнесла типовые штаммы к симбиовару anthyllidis, как и штаммы M. metallidurans STM2683, M. delmotii STM4623 и M. prunaredense STM4891, также выделенные из того же вида бобовых.